故事梗概　　

小学六年级的进藤光为了赚些零用钱，跑到爷爷家里寻宝，偶然翻出了一个旧棋盘。接触棋盘的一瞬间，附身于棋盘中的平安时代棋士——藤原佐为的灵魂进入了小光的体内。佐为将围棋视为生命，在他的熏陶下，小光也逐渐对围棋产生了兴趣。
　　光在围棋会所结识了棋坛名人之子——塔矢亮。为了测试佐为的实力，光贸然与亮对弈，结果小胜对手。他不知道塔矢亮的身份，误以为佐为棋力平常，对此深为不满。然而塔矢亮却大受打击，失意至极。数日后，亮再次向光挑战，虽然他对光藐视围棋的态度十分气愤，但是无奈再次惨败在佐为手下。
　　光应朋友之邀，前往叶濑中学参加校庆活动。他冒充初中生加入叶濑中学团队参加校际围棋赛。在团体赛的决赛中，借助佐为的力量连克强敌，结果叶濑中学力挫名校海王中学，夺得了冠军。可惜有人揭发小光还是个小学生，因此被大赛取消了名次。
　　不久后，光升入叶濑中学，并加入了围棋部。与此同时，塔矢亮也考入了海王中学，为了和光对局，他专程前往叶濑中学挑战。但是，光深知自己远远不是亮的对手，断然回绝。亮得知光即将参加校际围棋比赛后，为了与他一决高下，不惜加入海王中学围棋部。
　　光发现同年级的三谷棋艺出众，便邀请他加入围棋部。三谷在围棋会所与大人赌博，并且作弊骗钱。不料反被骗走1万日元。光借助佐为的力量，帮助三谷夺回了赌金。在他的不懈努力下，三谷终于同意参加校际围棋团体赛。亮在得知光将在团体赛中担任叶濑中学末将后，以退部为要挟获得海王中学末将资格。
　　围棋大赛上，三谷出任主帅，筒井、光分别担任二将、三将。光与亮第三次交锋，在犹豫不决中光最终决定亲自与亮对弈，以了解自己与对手的差距。但由于水平差距悬殊，结果以惨败告终。筒井与三谷也不敌对手，叶濑中学在第二回合便被淘汰出局。亮对光的实力大为失望，决意参加职业棋士考试。
　　暑假，为了帮佐为寻找下棋对手，光学会网络围棋并化名为sai四处挑战。sai的高超棋艺使其名扬海外。国际业余围棋赛在日本举行，选手们纷纷询问网上神秘高手sai的真正身份，赛场一片哗然。亮之后向sai发起挑战，却惊奇的发现sai的手法与小光如出一辙。为了不影响比赛，亮果断的中途投降，要求改日再战。
　　职业棋士考试第一天，亮不惜放弃首战，如约与sai展开对局。他虽全力以赴步步为营，却无奈佐为的棋艺出神入化，结果再次告负。亮怀疑 sai的真实身份便是光，又听说曾有人在网吧见过光，急忙赶去确认。光矢口否认自己曾在网上下棋，暗示塔矢不要追逐佐为的幻象，并正式向其发出挑战，塔矢不屑而去。
　　光棋力日渐增强。一天，他偶遇海王中学围棋部会长岸本，岸本的一席话惊醒了小光，使他决定参加院生考试。然而，一旦成为院生便无法参加业余比赛，因此激起了三谷的不满。在加贺的建议下，光以一敌三，同时与加贺、筒井、三谷对局，结果2胜1负。他告别了围棋部，迈向新的起点。
　　院生考试当天，光因为心情紧张，未能发挥出理想的水平。但主考老师得知他学习围棋不过一年时间，对其进步之快十分吃惊，并从小光以一敌三的棋谱中发现他有过人的素质，故破格给予其合格。
　　此时，亮已晋升为初段，他听说光成为院生，心中再次燃起昂扬斗志，决定远远将光抛在身后。与王座的比赛中，他为向光展现两人之间的实力差距，面对强敌毫不畏惧，步步紧逼锋芒毕露，令王座陷入苦战。
　　一年一度的幼狮战即将到来，为了能与亮再次交锋，身为院生二组最后一名的光在三个月内经过努力晋升至一组16名，获得了幼狮战的参赛资格。在比赛中，光巧妙地化恶手为妙手，令对手陷入苦战。虽然棋差一招未能出线，但他真切的感受到了自身的成长，塔矢也从残局中发现，光的实力已经今非昔比。
　　参加职业棋手考试，是院生们的第一目标，伊角、和谷等人在院生中名列前茅，可免预赛参加正式考试。光由于过于紧张，在预赛前两场比赛中连续告负，但此后状态逐渐恢复，最后一场比赛轮空不战而胜，以3胜2负的成绩通过预赛。和谷伊角为帮助小光积累经验，3人组队前往各个围棋会所挑战，光受益匪浅。
　　正式考试中，光沉着应战，战绩位居前列。决战在积分靠前的越智、伊角、和谷和光之间展开。伊角的无意犯规，使光违心地获得了1分。伊角情绪低落，连输2轮，但在与越智的比赛中再度燃起斗志并取胜。亮为了解光的实力，协助越智展开特训，不料光奇兵突袭，打乱了越智的阵脚。最终，光通过了职业考试。
　　光没有想到，自己首场职业比赛的对手竟是亮，不料由于塔矢名人急病卧床，亮未能参加比赛。光前往医院探望名人，为满足佐为的心愿，他请求名人和sai在网上一决胜负。名人答应了光的挑战，与佐为在网上展开了一场空前绝后的鏖战。两人棋逢对手，战局难分高下，最后佐为棋高一着，中盘取胜，完成了夙愿。
　　佐为发现，自己在人间的时日已经无多，他没有告诉光，只是默默的守护着光的成长。一天，光突然发现整日与自己形影不离的佐为失去了踪影。他四处寻找，却没有结果。光茫然若失，决意不再下棋。伊角从中国棋院回到日本，前来探望光，他再三要求与光对局，终于打动了光。手执棋子的刹那光不禁泪如泉涌，他突然明白了，原来佐为早已融入了自己的棋中。
　　光回到阔别数月的职业棋坛，再次与亮交锋。这一战虽然告负，但亮从光的身上，清楚地看见了佐为的身影。两位天才少年终于冰释前嫌，结为毕生的竞争对手。